Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UTRNP46939 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UTRNP46939 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UTRNP46939 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UTRNP46939 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UTRNP46939 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms