Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GNPDA1P46926 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms