Protein–RNA interactions for Protein: P46779

RPL28, 60S ribosomal protein L28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28P46779 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RPL28P46779 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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RPL28P46779 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RPL28P46779 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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