Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACADSBP45954 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACADSBP45954 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms