Protein–RNA interactions for Protein: P38204

RRN10, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN10, yeastyeast

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN10P38204 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN10P38204 SGO1YOR073W 1773 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN10P38204 SEC5YDR166C 2916 nt1.39□□□□□ -2.19
RRN10P38204 snR56snR56 88 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YGL217CYGL217C 342 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 RPL38YLR325C 237 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 TIM18YOR297C 579 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 NOC3YLR002C 1992 nt1.38□□□□□ -2.19
RRN10P38204 SDH2YLL041C 801 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YOR199WYOR199W 330 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN10P38204 INP2YMR163C 2118 nt1.37□□□□□ -2.19
RRN10P38204 SLX4YLR135W 2247 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YCS4YLR272C 3531 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 ZIP2YGL249W 2115 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 PMD1YER132C 5262 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 snR72snR72 98 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.36□□□□□ -2.19
RRN10P38204 FYV8YGR196C 2454 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 VPS54YDR027C 2670 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 RPS20YHL015W 366 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YOL160WYOL160W 342 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 BIL1YOR304C-A 231 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 CCH1YGR217W 6120 nt1.35□□□□□ -2.19
RRN10P38204 TRM732YMR259C 4263 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN10P38204 PET127YOR017W 2403 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN10P38204 CSN9YDR179C 489 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN10P38204 GIM4YEL003W 336 nt1.34□□□□□ -2.19
RRN10P38204 EST2YLR318W 2655 nt1.34□□□□□ -2.2
RRN10P38204 SSK2YNR031C 4740 nt1.34□□□□□ -2.2
RRN10P38204 RIM20YOR275C 1986 nt1.34□□□□□ -2.2
RRN10P38204 FIG2YCR089W 4830 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YJL135WYJL135W 318 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YSY6YBR162W-A 198 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 SCW11YGL028C 1629 nt1.33□□□□□ -2.2
RRN10P38204 NPC2YDL046W 522 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YLL054CYLL054C 2532 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN10P38204 MAD1YGL086W 2250 nt1.32□□□□□ -2.2
RRN10P38204 MSH3YCR092C 3057 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN10P38204 snR14snR14 160 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YPR197CYPR197C 564 nt1.31□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YJL015CYJL015C 285 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN10P38204 PCC1YKR095W-A 267 nt1.3□□□□□ -2.2
RRN10P38204 NIP100YPL174C 2607 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 AZF1YOR113W 2745 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YDL211CYDL211C 1119 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YDR426CYDR426C 378 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.29□□□□□ -2.2
RRN10P38204 YLR422WYLR422W 5799 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 RAD34YDR314C 2079 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 MSN5YDR335W 3675 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 CDC25YLR310C 4770 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 SLI15YBR156C 2097 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 SEC21YNL287W 2808 nt1.28□□□□□ -2.2
RRN10P38204 PBY1YBR094W 2262 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN10P38204 RPL35AYDL191W 363 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN10P38204 ALY2YJL084C 3141 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN10P38204 SWI4YER111C 3282 nt1.27□□□□□ -2.21
RRN10P38204 NUP188YML103C 4968 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 MPT5YGL178W 2580 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 SPT21YMR179W 2277 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 LCD1YDR499W 2244 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 SPC98YNL126W 2541 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 PIK1YNL267W 3201 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 PIP2YOR363C 2991 nt1.26□□□□□ -2.21
RRN10P38204 COG4YPR105C 2586 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN10P38204 HTB2YBL002W 396 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN10P38204 MDS3YGL197W 4464 nt1.25□□□□□ -2.21
RRN10P38204 MAM33YIL070C 801 nt1.24□□□□□ -2.21
RRN10P38204 ATP6Q0085 780 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN10P38204 AIM44YPL158C 2277 nt1.23□□□□□ -2.21
RRN10P38204 APL3YBL037W 3078 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN10P38204 CDC36YDL165W 576 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN10P38204 YIR044CYIR044C 186 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN10P38204 RRT15YLR162W-A 189 nt1.22□□□□□ -2.21
RRN10P38204 YGR130CYGR130C 2451 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 MMS4YBR098W 2076 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 LAA1YJL207C 6045 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 YJR011CYJR011C 786 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 YAF9YNL107W 681 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.21□□□□□ -2.22
RRN10P38204 YPR063CYPR063C 423 nt1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 273.1 ms