Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PPARGP37231 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PPARGP37231 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PPARGP37231 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPARGP37231 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms