Protein–RNA interactions for Protein: P36104

SWD2, COMPASS component SWD2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SWD2P36104 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1□□□□□ -2.25
SWD2P36104 YML003WYML003W 873 nt1□□□□□ -2.25
SWD2P36104 snR41snR41 95 nt1□□□□□ -2.25
SWD2P36104 SET3YKR029C 2256 nt1□□□□□ -2.25
SWD2P36104 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt0.99□□□□□ -2.25
SWD2P36104 UBC7YMR022W 498 nt0.98□□□□□ -2.25
SWD2P36104 RRT1YBL048W 312 nt0.98□□□□□ -2.25
SWD2P36104 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.98□□□□□ -2.25
SWD2P36104 BUD3YCL014W 4911 nt0.98□□□□□ -2.25
SWD2P36104 AIM44YPL158C 2277 nt0.98□□□□□ -2.25
SWD2P36104 SIP4YJL089W 2490 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 NUP157YER105C 4176 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 CBS1YDL069C 690 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 GAL7YBR018C 1101 nt0.97□□□□□ -2.25
SWD2P36104 LCD1YDR499W 2244 nt0.96□□□□□ -2.26
SWD2P36104 NPC2YDL046W 522 nt0.96□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.96□□□□□ -2.26
SWD2P36104 ZIP2YGL249W 2115 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 SLI15YBR156C 2097 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 AIM9YER080W 1884 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 TTI1YKL033W 3117 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 APL1YJR005W 2103 nt0.95□□□□□ -2.26
SWD2P36104 SLD3YGL113W 2007 nt0.94□□□□□ -2.26
SWD2P36104 MMS4YBR098W 2076 nt0.94□□□□□ -2.26
SWD2P36104 MRPL50YNR022C 420 nt0.94□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YJR003CYJR003C 1560 nt0.94□□□□□ -2.26
SWD2P36104 STO1YMR125W 2586 nt0.94□□□□□ -2.26
SWD2P36104 KAP120YPL125W 3099 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 PDE2YOR360C 1581 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 RPL34BYIL052C 366 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 HCH1YNL281W 462 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YPL229WYPL229W 621 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 FIG4YNL325C 2640 nt0.93□□□□□ -2.26
SWD2P36104 VAM6YDL077C 3150 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YJL135WYJL135W 318 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YOR199WYOR199W 330 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YPL261CYPL261C 309 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 COG4YPR105C 2586 nt0.92□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YPR117WYPR117W 7470 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 SDH7YDR511W 402 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YOL160WYOL160W 342 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 IRC23YOR044W 474 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 RPB10YOR210W 213 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 PAN2YGL094C 3348 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YJR029WYJR029W 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt0.91□□□□□ -2.26
SWD2P36104 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt0.9□□□□□ -2.27
SWD2P36104 BEM2YER155C 6504 nt0.9□□□□□ -2.27
SWD2P36104 IFH1YLR223C 3258 nt0.9□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YAP6YDR259C 1152 nt0.89□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YJL007CYJL007C 315 nt0.89□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YAR047CYAR047C 321 nt0.89□□□□□ -2.27
SWD2P36104 snR51snR51 107 nt0.89□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YAR009CYAR009C 3591 nt0.88□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YDL073WYDL073W 2955 nt0.88□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YKL083WYKL083W 615 nt0.88□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YLR456WYLR456W 615 nt0.88□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YDL206WYDL206W 2289 nt0.87□□□□□ -2.27
SWD2P36104 PRP16YKR086W 3216 nt0.87□□□□□ -2.27
SWD2P36104 snR72snR72 98 nt0.87□□□□□ -2.27
SWD2P36104 RPS24BYIL069C 408 nt0.87□□□□□ -2.27
SWD2P36104 Q0017Q0017 162 nt0.87□□□□□ -2.27
SWD2P36104 RPL26AYLR344W 384 nt0.86□□□□□ -2.27
SWD2P36104 RAD34YDR314C 2079 nt0.85□□□□□ -2.27
SWD2P36104 GPG1YGL121C 381 nt0.85□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YHL041WYHL041W 450 nt0.85□□□□□ -2.27
SWD2P36104 ISF1YMR081C 1017 nt0.85□□□□□ -2.27
SWD2P36104 INP2YMR163C 2118 nt0.84□□□□□ -2.27
SWD2P36104 YNL058CYNL058C 951 nt0.84□□□□□ -2.27
SWD2P36104 SCC2YDR180W 4482 nt0.84□□□□□ -2.28
SWD2P36104 PCF11YDR228C 1881 nt0.84□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YGR042WYGR042W 816 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YHL042WYHL042W 453 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 RIM20YOR275C 1986 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 WAR1YML076C 2835 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 NIP100YPL174C 2607 nt0.83□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YDL196WYDL196W 330 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 ATG31YDR022C 591 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YIR044CYIR044C 186 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YKL063CYKL063C 504 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YPL185WYPL185W 396 nt0.82□□□□□ -2.28
SWD2P36104 PKH2YOL100W 3246 nt0.81□□□□□ -2.28
SWD2P36104 DOP1YDR141C 5097 nt0.8□□□□□ -2.28
SWD2P36104 YPL205CYPL205C 345 nt0.8□□□□□ -2.28
SWD2P36104 RPS20YHL015W 366 nt0.79□□□□□ -2.28
SWD2P36104 PAC1YOR269W 1485 nt0.79□□□□□ -2.28
SWD2P36104 RPL38YLR325C 237 nt0.78□□□□□ -2.28
SWD2P36104 CUL3YGR003W 2235 nt0.77□□□□□ -2.29
SWD2P36104 ISD11YER048W-A 285 nt0.77□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 144 ms