Protein–RNA interactions for Protein: P34077

NIC96, Nucleoporin NIC96, yeastyeast

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIC96P34077 UFD4YKL010C 4452 nt2.01□□□□□ -2.09
NIC96P34077 TBS1YBR150C 3285 nt2□□□□□ -2.09
NIC96P34077 CDC36YDL165W 576 nt2□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YBR064WYBR064W 429 nt2□□□□□ -2.09
NIC96P34077 HSH155YMR288W 2916 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 snR60snR60 104 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 SDH2YLL041C 801 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 ABF2YMR072W 552 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YOR225WYOR225W 330 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.99□□□□□ -2.09
NIC96P34077 BLI1YKL061W 342 nt1.98□□□□□ -2.09
NIC96P34077 INP2YMR163C 2118 nt1.98□□□□□ -2.09
NIC96P34077 PUT3YKL015W 2940 nt1.98□□□□□ -2.09
NIC96P34077 DGR2YKL121W 2559 nt1.98□□□□□ -2.09
NIC96P34077 UTP22YGR090W 3714 nt1.97□□□□□ -2.09
NIC96P34077 PAU3YCR104W 375 nt1.97□□□□□ -2.09
NIC96P34077 YNL337WYNL337W 255 nt1.97□□□□□ -2.09
NIC96P34077 RPB10YOR210W 213 nt1.97□□□□□ -2.09
NIC96P34077 SCW11YGL028C 1629 nt1.97□□□□□ -2.09
NIC96P34077 NEO1YIL048W 3456 nt1.96□□□□□ -2.1
NIC96P34077 SAS3YBL052C 2496 nt1.96□□□□□ -2.1
NIC96P34077 ENV11YGR071C 2583 nt1.96□□□□□ -2.1
NIC96P34077 UTP21YLR409C 2820 nt1.96□□□□□ -2.1
NIC96P34077 BRE1YDL074C 2103 nt1.96□□□□□ -2.1
NIC96P34077 LHS1YKL073W 2646 nt1.95□□□□□ -2.1
NIC96P34077 SFB2YNL049C 2631 nt1.95□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YJL135WYJL135W 318 nt1.95□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.95□□□□□ -2.1
NIC96P34077 GCN2YDR283C 4980 nt1.95□□□□□ -2.1
NIC96P34077 SRP14YDL092W 441 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 SSS1YDR086C 243 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YOR093CYOR093C 4947 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 ATG11YPR049C 3537 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 MYO2YOR326W 4725 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 NPR2YEL062W 1848 nt1.94□□□□□ -2.1
NIC96P34077 APL2YKL135C 2181 nt1.93□□□□□ -2.1
NIC96P34077 PIG1YLR273C 1947 nt1.93□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt1.93□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YOR015WYOR015W 360 nt1.93□□□□□ -2.1
NIC96P34077 SKI3YPR189W 4299 nt1.92□□□□□ -2.1
NIC96P34077 INA22YIR024C 651 nt1.92□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.92□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YNL144CYNL144C 2223 nt1.92□□□□□ -2.1
NIC96P34077 FKS1YLR342W 5631 nt1.92□□□□□ -2.1
NIC96P34077 APQ12YIL040W 417 nt1.91□□□□□ -2.1
NIC96P34077 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.91□□□□□ -2.1
NIC96P34077 LCD1YDR499W 2244 nt1.91□□□□□ -2.1
NIC96P34077 ADR1YDR216W 3972 nt1.91□□□□□ -2.1
NIC96P34077 PKH3YDR466W 2697 nt1.9□□□□□ -2.1
NIC96P34077 MPT5YGL178W 2580 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 Q0032Q0032 291 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 snR72snR72 98 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 CSE2YNR010W 450 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YOL160WYOL160W 342 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 IES4YOR189W 351 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 KCS1YDR017C 3153 nt1.9□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YCK3YER123W 1575 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 FIG2YCR089W 4830 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 snR55snR55 98 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 PAU2YEL049W 363 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YGL052WYGL052W 306 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 ZIP2YGL249W 2115 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 EMC5YIL027C 426 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 DNF3YMR162C 4971 nt1.89□□□□□ -2.11
NIC96P34077 VIK1YPL253C 1944 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 PAM16YJL104W 450 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YNL028WYNL028W 318 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YNL198CYNL198C 303 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 IRC20YLR247C 4671 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 FAB1YFR019W 6837 nt1.88□□□□□ -2.11
NIC96P34077 RPL31AYDL075W 342 nt1.87□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YMR321CYMR321C 318 nt1.87□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YOR302WYOR302W 78 nt1.87□□□□□ -2.11
NIC96P34077 SPT21YMR179W 2277 nt1.87□□□□□ -2.11
NIC96P34077 NIP100YPL174C 2607 nt1.87□□□□□ -2.11
NIC96P34077 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.86□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YGL007C-AYGL007C-A 87 nt1.86□□□□□ -2.11
NIC96P34077 GPG1YGL121C 381 nt1.86□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt1.86□□□□□ -2.11
NIC96P34077 PFD1YJL179W 330 nt1.85□□□□□ -2.11
NIC96P34077 ATP7YKL016C 525 nt1.85□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YCL023CYCL023C 348 nt1.85□□□□□ -2.11
NIC96P34077 SPC98YNL126W 2541 nt1.85□□□□□ -2.11
NIC96P34077 CTF4YPR135W 2784 nt1.85□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YER172C-AYER172C-A 381 nt1.84□□□□□ -2.11
NIC96P34077 YBL012CYBL012C 402 nt1.84□□□□□ -2.11
NIC96P34077 MAD1YGL086W 2250 nt1.84□□□□□ -2.12
NIC96P34077 YCS4YLR272C 3531 nt1.84□□□□□ -2.12
NIC96P34077 VPS54YDR027C 2670 nt1.84□□□□□ -2.12
NIC96P34077 LRE1YCL051W 1752 nt1.83□□□□□ -2.12
NIC96P34077 PDE2YOR360C 1581 nt1.83□□□□□ -2.12
NIC96P34077 NUT1YGL151W 3399 nt1.83□□□□□ -2.12
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