Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AL139317.3-201ENST00000555969 898 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DSG3P32926 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DSG3P32926 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DSG3P32926 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms