Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ERBB3P21860 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ERBB3P21860 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms