Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDK11BP21127 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDK11BP21127 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms