Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C4BPBP20851 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C4BPBP20851 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms