Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
EFNA1P20827 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
EFNA1P20827 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms