Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PSMB1P20618 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PSMB1P20618 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms