Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB4AP20338 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms