Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RAB3BP20337 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RAB3BP20337 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms