Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KRT4P19013 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KRT4P19013 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KRT4P19013 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
KRT4P19013 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KRT4P19013 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRT4P19013 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms