Protein–RNA interactions for Protein: P17213

BPI, Bactericidal permeability-increasing protein, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIP17213 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BPIP17213 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BPIP17213 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BPIP17213 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BPIP17213 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BPIP17213 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BPIP17213 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BPIP17213 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms