Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC5A1P13866 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC5A1P13866 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms