Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ACTN1P12814 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ACTN1P12814 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms