Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
VPREB1P12018 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
VPREB1P12018 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms