Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MS4A1P11836 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MS4A1P11836 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms