Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYP2C9P11712 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYP2C9P11712 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms