Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RARBP10826 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RARBP10826 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RARBP10826 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RARBP10826 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RARBP10826 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RARBP10826 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms