Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GLI4P10075 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GLI4P10075 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms