Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GLI3P10071 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GLI3P10071 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GLI3P10071 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GLI3P10071 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GLI3P10071 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GLI3P10071 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GLI3P10071 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GLI3P10071 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms