Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TRAPPC2BP0DI82 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms