Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
VIL1P09327 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIL1P09327 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VIL1P09327 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VIL1P09327 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VIL1P09327 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VIL1P09327 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VIL1P09327 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms