Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PKHD1P08F94 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PKHD1P08F94 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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