Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP3A4P08684 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms