Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTSLP07711 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTSLP07711 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTSLP07711 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CTSLP07711 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms