Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CENPBP07199 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CENPBP07199 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CENPBP07199 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CENPBP07199 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
CENPBP07199 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CENPBP07199 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CENPBP07199 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.7 ms