Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TYMSP04818 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TYMSP04818 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms