Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYCNP04198 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MYCNP04198 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYCNP04198 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYCNP04198 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms