Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FGAP02671 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FGAP02671 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FGAP02671 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FGAP02671 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FGAP02671 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FGAP02671 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGAP02671 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGAP02671 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FGAP02671 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms