Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SAP30O75446 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SAP30O75446 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms