Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
KDM4AO75164 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
KDM4AO75164 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms