Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPHP4O75161 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NPHP4O75161 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms