Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF40O75150 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF40O75150 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF40O75150 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF40O75150 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF40O75150 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF40O75150 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF40O75150 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF40O75150 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF40O75150 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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