Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CUBNO60494 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CUBNO60494 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CUBNO60494 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CUBNO60494 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms