Protein–RNA interactions for Protein: O60481

ZIC3, Zinc finger protein ZIC 3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC3O60481 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ZIC3O60481 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms