Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CEP104O60308 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP104O60308 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP104O60308 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP104O60308 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CEP104O60308 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CEP104O60308 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CEP104O60308 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CEP104O60308 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CEP104O60308 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CEP104O60308 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms