Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EFNA2O43921 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EFNA2O43921 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms