Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EXTL3O43909 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EXTL3O43909 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms