Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EDIL3O43854 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EDIL3O43854 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms