Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
STRNO43815 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
STRNO43815 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
STRNO43815 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
STRNO43815 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
STRNO43815 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
STRNO43815 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
STRNO43815 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms