Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYNGR3O43761 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SYNGR3O43761 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms