Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYNGR2O43760 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms