Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCP110O43303 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms