Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MEFVO15553 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MEFVO15553 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MEFVO15553 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MEFVO15553 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MEFVO15553 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MEFVO15553 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms